本站消息 近日，學校動物科學技術學院趙桂英教授團隊在Nature子刊《Scientific Data》（JCR Q1，IF5 years=8.9）及《DNA Research》先后發表題為“Comprehensive visceral transcriptome profiling of three pig breeds along altitudinal gradients in Yunnan”和“Integrative transcriptomic analysis reveals alternative splicing complexity and transcriptomic diversity in porcine placentas across altitudes”的研究論文。該研究通過系統構建不同海拔梯度特色豬種心、肝、脾、肺、腎及胎盤等多組織轉錄組全景圖譜，采用整合生物信息學分析方法，首次闡釋了可變剪接事件通過調控轉錄組多樣性影響地方豬種高原環境適應的分子機制。
氧穩態的維持是多細胞生物生存的重要生物學基礎，機體通過精密調控基因表達網絡以適應低氧微環境，從而保障細胞存活及組織正常發育。云南復雜的垂直氣候梯度孕育了豐富的地方豬種質資源，為高原低氧適應性研究提供了理想的大型哺乳動物模型。值得關注的是，可變剪接作為一種重要的轉錄后調控機制，可動態調控動物生長發育及生理代謝等關鍵生物學進程，通過選擇性剪接異構體的生成賦予組織細胞轉錄組與蛋白質組功能多樣性。然而，可變剪接在高原家畜低氧適應中的分子調控機制仍不明確。
研究團隊通過系統整合長讀長Iso-seq和短讀長RNA-seq測序技術，成功構建了不同海拔梯度地方豬種的多組織全長轉錄組及可變剪接圖譜。研究揭示了高海拔與低海拔豬種在轉錄組的多樣性、可變剪接的復雜性等方面的顯著差異特征，鑒定了IGF1、MECOM、HIF1A、HSPA8等參與低氧適應性調控的關鍵功能基因。該研究成果不僅為地方豬種抗逆性優良種質資源的分子育種提供了新路徑，同時為其他哺乳動物高原低氧適應機制的研究提供了借鑒。
學校為論文第一署名單位，動物科學技術學院趙桂英教授為兩篇論文的通訊作者，霍金龍教授與研究生李昌堯分別為兩篇論文的第一作者。該研究得到了云南省科技廳重大科技專項“云南地方豬種業創新研究與應用”（202302AE090016）和國內外十余家科研機構與高等院校的鼎力支持。
論文鏈接：
Scientific Data: https://doi.org/10.1038/s41597-025-05070-0
DNA Research: https://academic.oup.com/dnaresearch/article/32/3/dsaf008/8154087?searchresult=1
